日本きのこ学会(にほんきのこがっかい、英:Japanese Society of Mushroom Science and Biotechnology)は、キノコを研究する応用技術の学術団体である。1989年に前身となるきのこ技術集談会が発足。1997年に日本応用きのこ学会に改組し、2006年に日本きのこ学会に改称。